疱疹性咽峡炎主要通过粪-口途径或呼吸道飞沫传播，也可经接触患者口鼻分泌物、疱疹液及被污染的手和物品等途径传播。
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的急性传染性咽峡炎，常见的病毒包括柯萨奇病毒A组、肠道病毒71型等。患者和隐性感染者是主要的传染源，其咽部和粪便中都可检出病毒。
在流行期间，疱疹性咽峡炎主要通过飞沫传播，比如患者咳嗽、打喷嚏时，病毒会随着飞沫散布在空气中，其他人吸入后就可能感染。此外，经手到口也是重要的传播途径，比如接触了被病毒污染的手或物品，然后再触摸自己的口腔，也可能会感染病毒。
由于疱疹性咽峡炎的传染性较强，所以在疾病流行期间，要注意保持良好的个人卫生习惯，如勤洗手、保持口腔清洁等，以减少感染的机会。同时，也要避免带孩子去人员密集的场所，以降低感染的风险。