孕晚期发现胎儿脑积水，需要综合胎儿脑积水的严重程度、孕周、孕妇和家属的意愿等因素，采取以下处理措施。
1.进一步检查：如果只是轻微的脑积水，且其他方面没有异常，可以在医生的指导下进行进一步的检查，如磁共振成像（MRI）等，以明确胎儿脑积水的原因和程度。
2.密切观察：如果胎儿脑积水的情况比较严重，或者伴有其他结构异常，医生可能会建议孕妇密切观察胎儿的情况，包括定期进行超声检查、胎心监护等，以及时发现问题。
3.终止妊娠：如果胎儿脑积水严重，且预后不佳，或者孕妇和家属希望终止妊娠，医生会根据具体情况，选择合适的终止妊娠方式，如引产、剖宫产等。
需要注意的是，胎儿脑积水的处理需要个体化，孕妇和家属应该与医生充分沟通，了解各种治疗方案的利弊，做出明智的选择。