一般情况下，乙肝小三阳患者可以办理健康证，但需要根据具体情况而定。
健康证是指预防性健康检查证明，证明受检者具备做从业规定的健康素质。乙肝小三阳是指乙肝五项检查中乙肝表面抗原（HBsAg）、乙肝e抗体（HBeAb）和乙肝核心抗体（抗HBc）阳性，但乙肝病毒DNA载量较低、肝功能正常的一种乙肝病毒感染状态。
根据《食品安全法》及其实施条例、《公共场所卫生管理条例》等法律法规的规定，乙肝小三阳患者在肝功能正常的情况下，一般可以办理健康证。但需要注意的是，以下情况可能会影响健康证的办理：
1.从事直接接触食品、饮用水生产经营工作的人员：由于乙肝小三阳患者可能存在病毒传播的风险，因此可能会被限制办理健康证。
2.从事公共场所服务工作的人员：如美容美发、洗浴、住宿等行业的工作人员，由于乙肝小三阳患者可能会通过接触传播的方式将病毒传播给他人，因此可能会被限制办理健康证。
3.其他特殊行业的人员：如保育员、医护人员等，由于工作中可能会接触到他人的血液或体液，因此可能会被限制办理健康证。
总之，乙肝小三阳患者是否可以办理健康证，需要根据具体情况而定。建议在办理健康证前，先咨询当地的卫生部门或相关机构，了解具体的办理要求和流程。同时，乙肝小三阳患者也需要积极治疗，控制病情，避免病情进一步恶化。