早起肩膀酸疼可能由以下原因引起：
1.夜间睡姿不良：如果睡觉时长期保持一个姿势，或者枕头高度不合适，可能会导致肩膀部位的肌肉和韧带受到过度牵拉或压迫，引起晨起时肩膀酸疼。
2.肩部受凉：夜间睡眠时肩部受凉，如开窗、吹空调等，可能会导致肩部肌肉痉挛，引起疼痛。
3.肩周炎：肩周炎是一种常见的肩部疾病，主要表现为肩部疼痛、活动受限等。肩周炎可能在夜间发作，导致晨起时肩膀酸疼。
4.颈椎病：颈椎病也可能导致肩部疼痛，特别是神经根型颈椎病，疼痛可能放射至肩部。
5.其他原因：如肩部外伤、过度劳累、肩部肌肉劳损等，也可能引起早起肩膀酸疼。
针对早起肩膀酸疼的情况，可以采取以下措施：
1.调整睡眠姿势，选择合适的枕头，避免肩部受凉。
2.进行肩部的热敷、按摩等，可以缓解肌肉紧张，减轻疼痛。
3.适当进行肩部的活动和锻炼，如旋转肩膀、伸展手臂等，但要注意避免过度劳累。
4.如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，进行相关检查，如X光、CT等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果您有任何健康问题，建议及时就医，并遵循医生的建议进行治疗。