早晨起来肩膀酸疼，可能是以下原因引起：
1.夜间睡姿不良：如果睡觉时长期压迫肩膀，或使用过高的枕头，可导致肩部血液循环不良，进而引起酸疼。
2.肩部疾病：如肩周炎、肩袖损伤等，炎症或损伤可导致肩部疼痛。
3.颈椎病：颈椎间盘突出等颈椎病可压迫神经根，引起肩部放射性疼痛。
4.其他：风湿、类风湿性关节炎等也可能导致肩部疼痛。
如果经常出现早晨起来肩膀酸疼，或伴有其他症状，如肩部活动受限、上肢麻木等，建议及时就医，明确原因，并进行针对性治疗。同时，日常生活中应注意保持良好的睡姿，避免长时间低头或伏案工作，适当进行肩部运动，以预防肩部疾病的发生。