阴茎隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.感染：阴茎感染是导致疼痛的常见原因，如尿道炎、前列腺炎、附睾炎等。这些感染可能由细菌、病毒或其他病原体引起。
2.损伤或外伤：阴茎受到损伤、挫伤或割伤等外伤时，可能会引起疼痛。此外，过度自慰或性生活过于激烈也可能导致阴茎损伤。
3.阴茎疾病：某些阴茎疾病，如包茎、包皮过长、阴茎硬结症等，可能会引起疼痛。
4.精索静脉曲张：精索静脉曲张是精索内蔓状静脉丛的异常扩张、伸长和迂曲，可导致阴囊内温度升高，从而影响精子发生和成熟，也可能引起阴茎疼痛。
5.其他原因：阴茎疼痛还可能与其他因素有关，如结石、肿瘤、神经病变等。
需要注意的是，阴茎疼痛可能是严重疾病的症状之一，如阴茎癌、前列腺炎等。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如尿频、尿急、尿痛、排尿困难、发热等，应及时就医。医生会进行详细的身体检查和必要的实验室检查，以确定疼痛的原因，并给予相应的治疗。
对于特殊人群，如儿童、青少年和老年人，阴茎疼痛的原因可能有所不同。在儿童中，包茎、包皮过长等问题较为常见；在青少年中，性传播感染和精索静脉曲张可能是主要原因；而在老年人中，前列腺疾病和血管问题可能更为常见。
总之，阴茎隐隐作痛可能是多种原因引起的，需要及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取适当的治疗措施。同时，保持良好的个人卫生习惯，避免过度自慰和不洁性行为，有助于预防阴茎感染和其他疾病的发生。