来例假时小肚子两侧疼痛，可能与以下原因有关：
1.生理期反应：在月经期间，女性体内的激素水平会发生变化，这可能导致子宫收缩和盆腔充血，从而引起小肚子两侧的疼痛。这种疼痛通常是轻微的，并会随着月经的结束而逐渐减轻。
2.子宫内膜异位症：这是一种常见的妇科疾病，指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位。异位的子宫内膜在月经期间也会出血，但这些血液无法正常排出，从而导致盆腔内的炎症和疼痛。除了小肚子两侧疼痛外，还可能伴有痛经、性交疼痛、月经不调等症状。
3.盆腔炎：盆腔炎是指女性盆腔内的生殖器官及其周围结缔组织和盆腔腹膜发生的炎症。炎症可能导致小肚子两侧的疼痛、坠胀感，还可能伴有白带异常、发热等症状。
4.卵巢囊肿：卵巢囊肿是卵巢内的囊性结构，可能在月经期间破裂或扭转，从而引起小肚子两侧的疼痛。此外，卵巢囊肿还可能导致月经不规律、性交疼痛等症状。
5.其他原因：除了上述疾病外，小肚子两侧疼痛还可能与其他因素有关，如子宫肌瘤、宫颈炎、子宫内膜息肉等。
如果来例假时小肚子两侧疼痛持续时间较长、疼痛程度较严重，或伴有其他异常症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在月经期间，女性应注意保暖、避免劳累和过度运动，保持良好的生活习惯，有助于缓解疼痛。如果疼痛严重，可以使用热水袋热敷小肚子或服用止痛药，但应在医生的指导下使用。