月经长时间不干净可能是由多种原因引起的，以下是一些常见的原因：
1.激素失衡：（1）青春期或更年期：激素水平的波动可能导致月经不规律。（2）多囊卵巢综合征：这是一种常见的激素紊乱疾病，常导致月经周期不规律、出血量多或时间延长。（3）其他激素问题：如甲状腺功能异常、高泌乳素血症等也可能影响月经。
2.子宫内膜问题：（1）子宫内膜息肉：子宫内膜上的良性肿瘤，可能导致月经间期出血或月经延长。（2）子宫内膜增生：子宫内膜过度生长，也可能引起月经不规律。（3）子宫内膜癌：虽然比较少见，但需要排除这种可能性。
3.子宫肌瘤：子宫内的良性肿瘤，可能导致月经量增多、经期延长或月经间期出血。
4.其他妇科疾病：（1）盆腔炎：盆腔内的感染可能导致月经异常。（2）子宫内膜异位症：子宫内膜组织在子宫外生长，也可能引起月经问题。（3）子宫腺肌症：子宫内膜腺体和间质侵入子宫肌层，导致子宫增大和月经异常。
5.全身性疾病：（1）凝血功能障碍：血小板减少、凝血因子缺乏等血液系统疾病可能导致月经不止。（2）甲状腺功能亢进或减退：这些甲状腺疾病也可能影响月经。
6.医源性因素：（1）口服避孕药：使用不当或不适应避孕药可能导致月经异常。（2）宫内节育器：某些宫内节育器可能引起月经增多或经期延长。（3）其他药物：某些药物，如抗抑郁药、化疗药物等，可能影响月经。
如果月经长时间不干净，建议及时就医，进行详细的身体检查和相关的实验室检查，以确定具体原因并采取适当的治疗措施。医生可能会根据具体情况进行以下检查和治疗：
1.妇科检查：包括盆腔检查、B超等，以了解子宫和盆腔的情况。
2.激素测定：检测激素水平，以确定是否存在激素失衡。
3.其他检查：如血常规、凝血功能检查等，排除其他全身性疾病。
4.治疗方法：根据病因，治疗方法可能包括药物治疗、手术治疗或其他综合治疗措施。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，因此治疗方案应根据个体情况制定。及时就医并遵循医生的建议是解决月经问题的关键。此外，保持健康的生活方式，如均衡饮食、适量运动、减少压力等，也有助于维持月经的正常。