宫颈囊肿主要是由于宫颈腺管口狭窄或阻塞导致腺体分泌物引流受阻、潴留形成。
一、生理性变化引起
正常宫颈转化区鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或伸入腺管，将腺管口阻塞，导致腺体分泌物潴留形成囊肿，多无明显症状，一般无需特殊处理。
二、慢性炎症刺激导致
长期慢性炎症使宫颈组织反复发生充血、水肿，炎性细胞浸润，引起宫颈腺管口狭窄，进而形成囊肿。患者可能有白带增多等表现，需针对炎症进行相应处理。
三、宫颈损伤引发
如分娩、流产、手术操作等造成宫颈损伤，损伤修复过程中可能导致宫颈腺管口狭窄，引发囊肿。有相关损伤史的女性需关注宫颈情况。
四、绝经后情况
绝经后女性体内雌激素水平降低，宫颈腺萎缩，也可能出现宫颈囊肿，但一般不会有明显不适症状。