大拇指手指甲凹凸不平，可能与以下原因有关。
营养缺乏：指甲的生长需要多种营养物质，如蛋白质、维生素、矿物质等。如果身体缺乏这些营养物质，可能会导致指甲凹凸不平。
维生素：维生素A、B、C、E等对指甲的健康都很重要。缺乏维生素A可能导致指甲变薄、易碎；缺乏维生素B可能导致指甲出现条纹或凹陷；缺乏维生素C可能导致指甲变薄、易碎；缺乏维生素E可能导致指甲脆弱、易断裂。
矿物质：钙、铁、锌等矿物质对指甲的健康也很重要。缺乏钙可能导致指甲易碎；缺乏铁可能导致指甲变薄、易碎；缺乏锌可能导致指甲出现条纹或凹陷。
疾病：某些疾病也可能导致指甲凹凸不平，如银屑病、扁平苔藓、甲癣等。
银屑病：这是一种慢性炎症性皮肤病，可能导致指甲出现凹陷、凸起、变色等异常。
扁平苔藓：这是一种自身免疫性疾病，可能导致指甲出现凹陷、增厚、变色等异常。
甲癣：这是一种由真菌感染引起的疾病，可能导致指甲出现增厚、变色、凹陷等异常。
外伤：指甲受到外伤，如挤压、碰撞、咬伤等，可能导致指甲下出血、淤血，从而使指甲凹凸不平。
其他：长期接触某些化学物质、指甲感染、遗传因素等也可能导致指甲凹凸不平。
如果发现大拇指手指甲凹凸不平，建议及时就医，进行相关检查，以确定原因，并采取相应的治疗措施。同时，平时应注意保持指甲清洁卫生，避免长时间接触水和化学物质，避免指甲受到外伤。