13岁月经两个月没来，可能是由于青春期下丘脑-垂体-卵巢轴激素间的反馈调节尚未成熟、情绪波动、运动量过大等非疾病因素引起，也可能是由于多囊卵巢综合征、早发性卵巢功能不全等疾病因素导致。
一、非疾病因素
青春期时，下丘脑-垂体-卵巢轴激素间的反馈调节尚未成熟，可能导致月经周期不规律。此外，情绪波动、运动量过大、应激等因素也可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致月经失调。
二、疾病因素
1.多囊卵巢综合征：是一种常见的妇科内分泌疾病，以雄激素过高的临床或生化表现、持续无排卵、卵巢多囊改变为特征，常伴有胰岛素抵抗和肥胖。多发生于青春期及生育期妇女，月经异常是多囊卵巢综合征的主要症状之一，表现为月经稀发、量少、闭经或功能性子宫出血。
2.早发性卵巢功能不全：指女性在40岁以前出现卵巢功能减退，主要表现为月经异常（月经周期缩短、频发或经量减少）、雌激素缺乏相关症状（潮热、盗汗、性交困难、性欲下降等）以及不孕。
3.其他：其他可能导致13岁月经两个月没来的疾病还包括高催乳素血症、甲状腺功能异常、肾上腺皮质功能亢进等。
如果13岁月经两个月没来，同时伴有其他不适症状，如腹痛、乳房胀痛、情绪异常等，建议及时就医，进行相关检查，如性激素六项、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。此外，家长应关注孩子的心理和生理健康，给予孩子足够的关爱和支持。