同房三天后小腹微微痛可能是正常的，也可能是异常的，需要根据具体情况进行分析。
如果疼痛持续时间较短，程度较轻，没有其他不适症状，可能是由于同房时刺激子宫收缩、盆腔充血等原因引起的，一般不需要特殊处理，注意休息，保持会阴部清洁即可。
如果疼痛持续时间较长，程度较重，或伴有阴道出血、白带异常等症状，可能是由于妇科炎症、黄体破裂、异位妊娠等原因引起的，需要及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、尿常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
以下是可能导致同房三天后小腹微微痛的一些原因及治疗方法：
1.生理原因：
子宫收缩：同房时，性兴奋会引起子宫收缩，可能导致小腹微微痛。
盆腔充血：同房时，盆腔充血，可能引起小腹坠胀或疼痛。
其他：同房时动作过于剧烈、姿势不当等，也可能导致小腹疼痛。
处理方法：一般不需要特殊处理，注意休息，保持会阴部清洁。
2.病理原因：
妇科炎症：如盆腔炎、宫颈炎等，炎症刺激可能导致小腹疼痛，还可能伴有白带异常、异味等症状。
黄体破裂：如果在排卵期同房，可能导致黄体破裂，引起小腹剧痛，还可能伴有肛门坠胀感、恶心、呕吐等症状。
异位妊娠：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管，可能导致小腹疼痛，还可能伴有阴道出血等症状。
处理方法：需要及时就医，进行相关检查，明确病因，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，如果疼痛持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，以免延误病情。此外，同房时应注意卫生，避免动作过于剧烈，同时，如果有妇科炎症等疾病，应在治愈后再同房。