脚趾头缝里面长小水泡而且很痒，可能是以下原因引起的。
1.足癣：由真菌感染引起，具有传染性。常发生在脚趾间，初起为小水疱，逐渐融合成大疱，水疱内容物澄清，水疱干涸后出现脱屑，伴有明显瘙痒。搔抓后可出现糜烂、渗出，容易继发细菌感染，出现脓疱、红肿、疼痛。足癣可通过直接接触患者的鞋袜、洗脚盆、浴巾等物品而传染，也可通过间接接触被污染的物品而传染。此外，长期穿不透气的鞋子、足部多汗、糖尿病等也是足癣的高危因素。
2.湿疹：病因尚不明确，可能与过敏、自身免疫、遗传、感染、环境等因素有关。常对称分布，表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑等多形性皮疹，伴有明显瘙痒。可发生于任何部位，常见于手足、肘窝、腋窝、乳房、阴囊、肛周等部位。精神紧张、失眠、劳累、感染等因素可加重病情。
3.汗疱疹：病因尚不明确，可能与过敏、感染、局部多汗、精神紧张等因素有关。常发生在夏季，好发于手掌、足底、手指、足趾侧面，表现为深在性小水疱，疱壁紧张，粟粒至米粒大小，水疱干涸后出现脱屑，伴有明显瘙痒或烧灼感。汗疱疹可自行消退，但容易反复发作。
4.接触性皮炎：是皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应。病因可分为原发性刺激物和变态反应原两种。原发性刺激物主要有强酸、强碱、芥子气、芥子油等，变态反应原主要有金属及其制品、化妆品、洗涤剂、塑料制品等。接触性皮炎的临床表现与接触物的性质、接触方式、接触时间长短、接触部位等因素有关，轻者表现为红斑、丘疹、水疱，重者可出现表皮坏死、剥脱，甚至溃疡、坏死。
5.其他：维生素B1缺乏、系统性疾病（如糖尿病、尿毒症、肝胆疾病等）也可引起脚趾头缝长小水泡、瘙痒，需要及时就医，明确诊断。
如果脚趾头缝里长小水泡、瘙痒，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持足部清洁、干燥，避免搔抓，避免接触刺激性物质，勤换鞋袜，穿透气的鞋子。