睡一觉起来嗓子吞咽痛，可能与以下原因有关。
1.感染：睡眠时张口呼吸、病毒或细菌感染等，可导致嗓子局部黏膜发生炎症，从而引起疼痛、吞咽困难等症状。
病毒感染：常见的有流感病毒、鼻病毒、腺病毒等，可引起上呼吸道感染，出现嗓子疼痛、吞咽痛、鼻塞、流涕、咳嗽等症状。
细菌感染：如链球菌、葡萄球菌等，可引起扁桃体炎、咽炎等，也会出现嗓子疼痛、吞咽痛等症状。
2.创伤：睡眠时吞咽或咀嚼动作可能导致咽喉部黏膜受损，引起疼痛。
硬物划伤：如鱼刺、鸡骨等，可划伤咽喉部黏膜，引起疼痛。
器械损伤：如牙刷、假牙等，可损伤咽喉部黏膜，引起疼痛。
3.过敏：过敏原可刺激咽喉部黏膜，导致过敏反应，引起嗓子疼痛、吞咽痛、咳嗽等症状。
吸入过敏原：如花粉、尘螨、动物毛发等，可通过呼吸进入咽喉部，引起过敏反应。
食入过敏原：如海鲜、芒果、鸡蛋等，可通过进食进入咽喉部，引起过敏反应。
4.其他：如干燥、过度用嗓、胃食管反流病等，也可引起嗓子疼痛、吞咽痛等症状。
干燥：睡眠时空气干燥，可导致咽喉部黏膜干燥，引起疼痛。
过度用嗓：如长时间说话、唱歌等，可导致咽喉部黏膜充血、肿胀，引起疼痛。
胃食管反流病：胃酸反流可刺激咽喉部黏膜，引起疼痛、烧心、反酸等症状。
如果疼痛症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意休息，多喝水，避免食用辛辣、刺激性食物，保持口腔清洁。