引起小便时尿道出血、疼痛的原因有很多，常见的有以下几种：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、病毒等感染引起。除了尿道出血、疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
淋菌性尿道炎：主要由淋病奈瑟菌感染引起，多发生于不洁性接触后。患者尿道口红肿，有脓性分泌物，排尿时疼痛明显，可导致尿道出血。
非淋菌性尿道炎：由沙眼衣原体、支原体等感染引起。症状与淋菌性尿道炎相似，但相对较轻。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可由细菌感染引起。除了尿道出血、疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、下腹部疼痛等症状。
3.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，可由细菌感染或非感染因素引起。除了尿道出血、疼痛，还可能伴有会阴部、耻骨上区、腹股沟区等部位的疼痛不适，以及排尿异常、性功能障碍等症状。
4.尿道结石：尿道结石可导致尿道黏膜损伤，引起出血、疼痛。结石还可能阻塞尿道，导致排尿困难。
5.尿道损伤：尿道损伤可导致尿道黏膜破裂，引起出血、疼痛。常见的原因有骑跨伤、骨盆骨折等。
6.尿道肿瘤：尿道肿瘤可侵犯尿道黏膜，引起出血、疼痛。尿道肿瘤的症状还可能包括尿道肿块、排尿困难等。
7.其他原因：一些全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜等，也可能导致尿道出血、疼痛。
需要注意的是，尿道出血、疼痛可能是一种严重的症状，也可能是一些疾病的早期表现。如果出现这种情况，应及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、超声、CT等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
此外，在就医前应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免性生活，以免加重病情。同时，应避免食用辛辣、刺激性食物，多喝水，以促进排尿，有助于缓解症状。