跑步几天后膝盖正下方酸痛，可能与以下原因有关。
1.运动过度：如果跑步的时间过长、强度过大，或突然增加了跑步的距离和速度，可能会导致膝盖周围的肌肉、韧带和软骨受到过度的压力和磨损，从而引起疼痛。
2.姿势不正确：不正确的跑步姿势可能会增加膝盖的压力，导致膝盖正下方酸痛。例如，跑步时膝盖过度弯曲、内收或外展，或落脚过重等。
3.肌肉力量不足：如果腿部肌肉力量不足，无法有效地支撑身体的重量和运动，也容易导致膝盖疼痛。
4.其他因素：除了跑步，其他因素也可能导致膝盖正下方酸痛，如髌骨软化症、半月板损伤、滑膜炎等。
针对跑步后膝盖正下方酸痛的情况，可以采取以下措施。
1.休息：停止跑步，给膝盖足够的休息时间，让受损的组织得到修复。
2.冷敷：在疼痛的部位用冰袋冷敷，每次15-20分钟，每天数次，可以减轻炎症和疼痛。
3.热敷：在休息一段时间后，可以用热毛巾或热水袋在疼痛的部位热敷，促进血液循环，缓解疼痛。
4.按摩：轻轻按摩疼痛的部位，帮助放松肌肉，缓解紧张和疼痛。
5.拉伸：进行腿部肌肉的拉伸运动，增强肌肉的柔韧性和力量，有助于预防和缓解膝盖疼痛。
6.调整跑步姿势：保持正确的跑步姿势，注意膝盖的弯曲角度、落脚的方式和身体的重心等。
7.加强肌肉力量训练：通过进行腿部肌肉的力量训练，如深蹲、腿举等，可以增强肌肉的力量，减轻膝盖的压力。
8.寻求医疗帮助：如果疼痛持续时间较长、加重或伴有其他症状，如肿胀、僵硬、活动受限等，应及时寻求医生或物理治疗师的帮助，进行进一步的诊断和治疗。
需要注意的是，每个人的身体状况和原因都可能不同，如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。此外，在跑步前进行充分的热身运动，选择合适的跑鞋，也有助于预防膝盖疼痛的发生。