皮肤底下有硬疙瘩并伴有疼痛，可能是多种原因引起的，以下是一些可能的情况：1.皮脂腺囊肿：这是一种常见的皮肤良性肿瘤，通常由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成。囊肿呈圆形，位于皮肤表面，单发或多发，质地柔软，有弹性，高出皮面，有波动感，无自觉症状，可推动。感染时可有疼痛、化脓
2.脂肪瘤：是一种常见的软组织良性肿瘤，由成熟的脂肪细胞构成，可发生于身体任何有脂肪的部位。好发于肩、背、颈、乳房和腹部，其次为四肢近端（如上臂、大腿、臀部）。皮损为单个或多个皮下局限性肿块，呈扁圆形或分叶状，边界清楚，质地柔软，可有假囊性感，无压痛。生长缓慢，极少恶变
3.表皮样囊肿：是一种真皮内含有角质的囊肿，可能与外伤或表皮植入有关。可发生于任何年龄，但以青壮年多见。好发于头皮、颈部及臀、背部。囊肿呈圆形，与表皮粘连，质硬，有弹性，正常皮色，缓慢增大，无自觉症状。感染时可有疼痛
4.疖肿：是一种化脓性毛囊及毛囊深部周围组织的感染，相邻近的多个毛囊感染、炎症融合形成的皮肤深部脓肿。好发于头、面、颈、背部等毛囊和皮脂腺丰富的部位。初起为毛囊性炎症丘疹，基底浸润明显，以后炎症向周围扩展，形成圆锥形隆起，有明显的疼痛。数日后，中央变软，有波动感，顶部出现黄白色点状脓栓，脓栓脱落后有脓血和坏死组织排出，炎症逐渐消退而愈
5.痈：是多个相邻的毛囊及其所属皮脂腺或汗腺的急性化脓性感染，也可由多个疖融合而成。好发于颈项、背部等皮肤厚韧的部位。初起为弥漫性浸润的紫红色斑，迅速向周围扩展，中央部分随后坏死、化脓、形成多个脓栓，痈不仅可以向四周及深部组织扩展，还可以经淋巴及血液循环向全身扩散。患者可有明显的全身症状，如畏寒、发热、头痛、食欲不振等
6.其他：皮肤底下有硬疙瘩并伴有疼痛，还可能是其他原因引起的，如皮肤纤维瘤、神经纤维瘤、骨肉瘤、转移性肿瘤等。
总之，皮肤底下有硬疙瘩并伴有疼痛的原因很多，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确诊断，并进行相应的治疗。