明目地黄丸和杞菊地黄丸的区别主要体现在以下几个方面：
1.药物组成：明目地黄丸由熟地黄、酒萸肉、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻、枸杞子、菊花、当归、白芍、蒺藜、煅石决明组成。杞菊地黄丸是在明目地黄丸的基础上加了枸杞子和五味子。
2.功效：明目地黄丸具有明目滋阴的功效。杞菊地黄丸则具有滋肾养肝的功效。
3.主治：明目地黄丸主要用于治疗肝肾阴虚、目涩畏光、视物模糊、迎风流泪等。杞菊地黄丸对肝肾阴虚同时伴有头晕耳鸣、腰膝酸软等症状有较好的疗效。
4.不良反应：两者的不良反应尚不明确。但在服用时，都需要注意按照说明书或医生的建议剂量服用，避免长期大量使用。同时，对药物成分过敏者禁用，过敏体质者慎用。如果正在使用其他药物，使用前也需要咨询医生或药师，以免发生药物相互作用。
总之，虽然明目地黄丸和杞菊地黄丸都是眼科常用的中成药，但在药物组成、功效、主治等方面存在一定的差异。在使用时，需要根据具体情况选择合适的药物，并在医生的指导下使用。