新生儿先天性甲状腺功能低下主要通过终身服用左甲状腺素钠进行治疗，需尽早开始治疗以保证患儿正常生长发育和神经系统发育。
一、治疗起始时间
一旦确诊应立即开始治疗，出生后2 - 4周内开始治疗者，大部分患儿智力可接近正常；若6个月后才开始治疗，虽可改善甲状腺功能减退症状，但智能发育多已受损。
二、药物选择与调整
选择左甲状腺素钠作为替代治疗药物，治疗过程中需根据患儿血清甲状腺素（T4）、促甲状腺激素（TSH）水平调整药物剂量，使TSH维持在正常范围，T4正常高限或略高于正常水平。
三、定期监测
治疗开始后每1 - 2周需监测血清TSH和T4水平，根据监测结果调整药物剂量；在患儿生长发育过程中，还需监测身高、体重、骨龄等指标，以评估治疗效果和调整治疗方案。
四、特殊人群注意事项
对于新生儿先天性甲状腺功能低下患儿，要特别关注其神经系统发育情况，定期进行神经心理发育评估；同时要确保药物剂量准确，因为剂量不足会影响患儿生长发育，剂量过大可能导致甲亢，影响患儿健康。