精子畸形率高的原因主要有以下几点：
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张会导致睾丸局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响精子的发生。
2.生殖道感染：附睾炎、精囊炎、前列腺炎等生殖道感染，会影响精子的运动能力和受精能力。
3.内分泌异常：下丘脑-垂体-睾丸性腺轴功能紊乱，会影响精子的发生和成熟。
4.免疫因素：抗精子抗体可影响精子的活力和受精能力。
5.环境因素：长期接触有害化学物质、辐射、高温等环境因素，可能导致精子畸形率升高。
6.吸烟、饮酒：吸烟和饮酒会影响精子的活力和形态。
7.其他因素：高龄、遗传因素、精索静脉曲张、隐睾等也可能导致精子畸形率高。
需要注意的是，精子畸形率高并不意味着一定不能生育，只是受孕的几率可能会降低。如果发现精子畸形率高，应及时就医，进行详细的检查和治疗。同时，在日常生活中，应注意保持良好的生活习惯，避免接触有害物质，适当运动，提高精子质量。