早上起床后咳得很厉害，可能是以下几种疾病：
1.呼吸道感染：如感冒、咽炎、扁桃体炎等，这些疾病通常会导致喉咙疼痛、咳嗽等症状。此外，肺炎、支气管炎等下呼吸道感染也可能引起咳嗽，可能还伴有咳痰、呼吸困难等症状。
2.咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为刺激性干咳，通常在夜间或清晨加重。患者可能没有喘息、气急等典型哮喘症状，但气道反应性增高。
3.鼻后滴注综合征：鼻腔分泌物倒流刺激咽喉部，也会引起咳嗽。患者可能同时伴有鼻塞、流涕、打喷嚏等鼻部症状。
4.胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和咽喉部，可导致咳嗽。此外，还可能伴有烧心、反酸、嗳气等症状。
5.其他：如过敏、气道异物、慢性阻塞性肺疾病等也可能引起咳嗽。
如果咳嗽持续时间较长或伴有其他症状，如发热、喘息、呼吸困难等，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片或CT等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，应注意休息，避免劳累和吸烟，保持室内空气流通，避免接触过敏原。在医生的指导下，可以使用止咳祛痰药物、抗过敏药物、抗生素等进行治疗。具体治疗方案应根据个体情况而定。