早上起来咳得很厉害的原因可能有以下几种：
1.上呼吸道感染：病毒或细菌感染上呼吸道，可引起咳嗽。这种咳嗽通常会伴随流涕、咽痛等症状。
2.过敏：过敏原如花粉、尘螨等可刺激呼吸道，导致咳嗽。过敏引起的咳嗽通常在早晨或夜间加重。
3.鼻后滴注综合征：鼻腔分泌物倒流刺激咽喉部，可引起咳嗽。这种咳嗽常常伴有鼻塞、流涕等症状。
4.胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和咽喉部，也可导致咳嗽。患者可能会有烧心、反酸等症状。
5.慢性阻塞性肺疾病（COPD）：患者常有慢性咳嗽、咳痰等症状，在早晨起床时可能会加重。
6.其他原因：如支气管扩张、肺结核、肺癌等肺部疾病，以及心脏疾病等也可能引起咳嗽。
如果咳嗽严重或持续时间较长，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片或肺功能等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意保持室内空气湿润，避免吸烟和接触过敏原，多喝水，多休息。在医生的指导下，可以使用止咳祛痰药物、抗过敏药物等缓解症状。如果是感染引起的，可能需要使用抗生素或抗病毒药物治疗。此外，对于一些慢性疾病，如COPD，需要长期治疗和管理。