肠道有慢性炎症时，治疗方法主要包括对因治疗和对症治疗。具体治疗药物如下：
1.对因治疗：
感染性肠炎：由细菌、病毒、真菌、寄生虫等感染引起。如果是细菌感染，常用药物有诺氟沙星、环丙沙星等；如果是病毒感染，通常不需要使用抗病毒药物；如果是真菌感染，常用药物有氟康唑、伊曲康唑等；如果是寄生虫感染，常用药物有吡喹酮、阿苯达唑等。
溃疡性结肠炎：常用药物有氨基水杨酸制剂，如美沙拉嗪、奥沙拉嗪等；糖皮质激素，如泼尼松、地塞米松等；免疫抑制剂，如硫唑嘌呤、环孢素等。
克罗恩病：常用药物有氨基水杨酸制剂，如美沙拉嗪、奥沙拉嗪等；糖皮质激素，如泼尼松、地塞米松等；免疫抑制剂，如硫唑嘌呤、环孢素等；生物制剂，如英夫利昔单抗、阿达木单抗等。
2.对症治疗：
腹痛：常用药物有阿托品、山莨菪碱等。
腹泻：常用药物有蒙脱石散、双歧杆菌四联活菌片等。
发热：如果体温超过38.5℃，可以使用布洛芬、对乙酰氨基酚等退烧药。
需要注意的是，药物的使用需要在医生的指导下进行，根据患者的具体情况选择合适的药物和治疗方案。同时，患者还需要注意饮食卫生，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以及戒烟戒酒。