手指甲出现凹陷，可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：缺乏某些营养素，如铁、钙、维生素等，可能导致手指甲变薄、凹陷。
2.扁平苔藓：一种自身免疫性疾病，可影响指甲和皮肤，导致指甲出现凹陷、纵嵴等异常。
3.银屑病：这种皮肤病可能导致指甲出现凹陷、增厚、变色等异常。
4.感染：某些真菌感染或细菌感染，如灰指甲，可能引起指甲变形、凹陷。
5.外伤：手指甲受到严重的外伤，如挤压、撞击等，可能导致指甲下淤血、凹陷。
6.疾病：某些系统性疾病，如心脏病、糖尿病、肝硬化等，可能影响指甲的生长和健康，导致指甲凹陷。
7.遗传因素：某些指甲异常可能与遗传有关。
如果发现手指甲凹陷，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会根据具体情况采取以下治疗方法：
1.补充营养：如果是营养不良导致的，医生可能会建议补充缺乏的营养素。
2.治疗疾病：针对扁平苔藓、银屑病等原发病进行治疗。
3.抗真菌或抗菌治疗：如果是感染引起的，可能需要使用抗真菌或抗菌药物。
4.处理外伤：对于外伤导致的指甲凹陷，需要根据情况进行处理，如清创、包扎等。
5.治疗系统性疾病：对于与疾病相关的指甲凹陷，需要积极治疗原发病。
需要注意的是，指甲凹陷的原因可能较为复杂，治疗方法也因病因而异。在治疗过程中，患者应遵循医生的建议，注意指甲的护理，保持清洁，避免过度刺激。同时，如果指甲凹陷伴有其他症状，如疼痛、变色、肿胀等，应及时就医，以便进行更详细的诊断和治疗。