小便时尿道刺痛可能是尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等泌尿系统感染引起的，也可能是尿路结石、尿道狭窄等其他疾病导致的。治疗方法需要根据具体病因确定，以下是一些常见的治疗方法：
1.一般治疗：注意休息，多饮水，勤排尿，避免憋尿和久坐。保持会阴部清洁，避免逆行感染。
2.药物治疗：根据病原体选择合适的抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。如果是膀胱炎或尿道炎，还可以使用三金片、热淋清等中成药辅助治疗。对于前列腺炎患者，除了使用抗生素外，还可能需要使用α-受体阻滞剂、非甾体抗炎镇痛药等。
3.手术治疗：如果是尿路结石、尿道狭窄等导致的尿道刺痛，可能需要手术治疗，如体外冲击波碎石、尿道扩张术等。
4.其他治疗：对于病因不明或久治不愈的尿道刺痛，可能需要进行进一步检查，如尿道镜检查、尿培养+药敏等，以明确病因并制定个性化治疗方案。
需要注意的是，尿道刺痛的治疗方法需要根据具体病情而定，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应避免性生活，以免加重病情或引起交叉感染。