复杂性肛瘘是一种肛门直肠疾病，是肛瘘中的一种难治类型。瘘管位于肛门外括约肌深部以下，有支管和空腔，内口位于肛窦，病程较长，多有急性发作和脓肿形成史。
复杂性肛瘘的病因主要与肛腺感染有关，肛窦开口向上，易受损伤，细菌可由此进入肛腺，引起感染。感染逐渐向外扩散，形成肛门直肠周围脓肿。如果脓肿自行破溃或经切开引流后，原发感染灶得到控制，但腔壁已成为结缔组织增生的管道，难以愈合，常需手术治疗。
复杂性肛瘘的治疗方法主要有以下几种：
1.瘘管切开术：是将瘘管全部切开开放，靠肉芽组织生长使伤口愈合的方法。适用于低位肛瘘。
2.挂线疗法：是利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的方法。适用于距肛门3～5cm内，有内外口低位或高位单纯性肛瘘，或作为复杂性肛瘘切开、切除的辅助方法。
3.肛瘘切除术：切开瘘管并将瘘管壁全部切除至健康组织，创面不予缝合；若创面较大，可部分缝合，部分敞开，用红油膏纱条引流。适用于低位单纯性肛瘘。
复杂性肛瘘的治疗较为复杂，需要根据具体情况选择合适的治疗方法。在治疗过程中，患者需要注意饮食清淡，保持肛门清洁，避免久坐久站，定期复查。