脖子两侧不舒服，可考虑以下科室：
1.骨科：颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等颈椎疾病，或颈部肌肉、韧带损伤等，都可能导致脖子两侧不舒服。骨科医生会进行详细的体格检查、影像学检查等，以明确诊断，并制定相应的治疗方案。
2.疼痛科：颈部疼痛是疼痛科的常见病症之一，医生会根据疼痛的性质、程度、范围等，采取药物治疗、物理治疗、神经阻滞等方法，缓解疼痛。
3.普外科：颈部两侧的肿块、炎症等，也可能与普外科相关。医生会进行触诊、超声等检查，以确定病因，并给予相应的治疗。
4.神经内科：如果脖子两侧的不舒服伴有上肢麻木、无力、头晕等症状，可能是神经系统疾病引起的。神经内科医生会进行神经系统检查，以明确诊断。
5.内分泌科：甲状腺疾病，如甲亢、甲减等，也可能导致脖子两侧不适。内分泌科医生会通过甲状腺功能检查、超声等，明确诊断，并给予相应的治疗。
需要注意的是，以上科室的诊断和治疗可能会相互协作，具体的治疗方案应根据患者的具体情况而定。此外，长时间低头、伏案工作、颈部受寒等，也可能导致脖子两侧不舒服。在日常生活中，应注意保持正确的姿势，避免长时间低头，注意颈部保暖。如果脖子两侧不舒服的症状持续不缓解或加重，应及时就医，以免延误病情。