大便时肛门痛，可能是以下原因引起：
1.肛裂：
病因：肛裂是肛管皮肤全层纵行裂开后形成的感染性溃疡，主要由便秘或腹泻导致肛管皮肤损伤引起。
原理：肛管表面被覆的是移行上皮，其下有丰富的感觉神经末梢，当肛管皮肤被撕裂后，会产生剧烈的疼痛。
2.外痔：
病因：外痔是齿状线以下痔外静脉丛扩大曲张或破裂形成的柔软静脉团，主要由肛垫下移和静脉曲张引起。
原理：外痔位于肛管的外部，当大便通过时，会直接刺激外痔，引起疼痛。
3.肛管炎：
病因：肛管炎是肛管的炎症性病变，主要由肛窦炎、肛乳头炎等肛管感染引起。
原理：肛管炎会导致肛管黏膜充血、水肿，大便时刺激肛管黏膜，引起疼痛。
4.其他：
肛门周围脓肿：肛门周围脓肿是指肛门周围软组织发生的急性化脓性感染，脓肿破溃后可形成肛瘘，也会引起肛门疼痛。
肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的肿瘤也会引起肛门疼痛，同时还可能伴有大便习惯改变、便血等症状。
治疗方法：
1.肛裂：
非手术治疗：保持大便通畅，局部坐浴，外用痔疮膏等。
手术治疗：肛裂切除术、肛管内括约肌切断术等。
2.外痔：
非手术治疗：局部热敷、坐浴，外用痔疮膏等。
手术治疗：血栓性外痔剥离术、外痔切除术等。
3.肛管炎：
抗生素治疗：口服或静脉滴注抗生素，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。
局部用药：外用痔疮膏、栓剂等。
其他治疗：中药坐浴、灌肠等。
4.其他：
脓肿切开引流：对于肛门周围脓肿，应及时切开引流，排出脓液。
手术治疗：对于肛管或直肠肿瘤，应根据肿瘤的性质、部位、大小等因素，选择合适的手术方式。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据患者的具体情况而定。如果出现大便时肛门痛的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，应注意保持肛门局部清洁，避免久坐、久站，多吃蔬菜水果，保持大便通畅。