月经结束后小腹仍隐隐作痛，可能与以下因素有关。
1.妇科疾病
盆腔炎：女性生殖系统有炎症时，可导致盆腔充血、水肿，在月经结束后，可能会出现小腹隐隐作痛的症状。
子宫内膜异位症：异位的子宫内膜可随月经周期发生变化，导致月经结束后小腹仍疼痛。
子宫肌瘤：较大的子宫肌瘤可影响子宫收缩，导致月经结束后小腹疼痛。
2.其他因素
排卵痛：部分女性在排卵期可能会出现下腹疼痛，这是由于排卵时卵泡破裂，卵泡液对腹膜的刺激所致。
慢性阑尾炎：阑尾位于右下腹，慢性阑尾炎可导致右下腹疼痛，有时疼痛可放射至小腹。
心理因素：精神紧张、压力过大等心理因素也可能导致小腹疼痛。
如果月经结束后小腹疼痛持续不缓解，或伴有其他症状，如发热、阴道分泌物异常、性交痛等，应及时就医，进行相关检查，如B超、血常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应注意个人卫生，保持心情愉悦，避免过度劳累和剧烈运动。