5毫米肾结石的治疗方法主要包括以下几种：
1.保守治疗：多喝水，多运动，促进结石排出。一般适用于结石直径小于0.6厘米、表面光滑、无尿路梗阻、无感染的患者。
2.体外冲击波碎石：利用体外冲击波聚焦后击碎体内的结石，使之随尿液排出体外。适用于直径小于2厘米的肾结石，或直径小于1.5厘米的输尿管结石。
3.输尿管镜取石或碎石：通过尿道插入输尿管镜，用激光或气压弹道等方法将结石击碎取出。适用于输尿管中下段结石，或体外冲击波碎石失败者。
4.经皮肾镜取石或碎石：在腰部建立一条从皮肤到肾脏的通道，通过这个通道插入肾镜，用激光或超声等方法将结石击碎取出。适用于较大的肾结石，或存在其他治疗方法禁忌证的患者。
肾结石是晶体物质（如钙、草酸、尿酸等）在肾脏内异常聚积所致，可引起腰部疼痛、血尿、恶心、呕吐等症状。治疗方法的选择应根据结石的大小、位置、数量、肾功能等因素综合考虑，建议在医生的指导下进行。