怀孕初期孕酮偏低的原因主要有以下几点：
1.黄体功能不全：(1)怀孕初期，卵巢排卵后形成的黄体分泌孕激素不足，导致孕酮偏低。(2)黄体功能不全可能与黄体期缩短、黄体萎缩过早等因素有关。
2.肾上腺、甲状腺功能失调：(1)怀孕初期，肾上腺、甲状腺功能失调，可影响卵巢功能，导致孕酮分泌不足。(2)这可能与自身免疫性疾病、内分泌紊乱等因素有关。
3.胎儿发育异常：(1)在怀孕初期，若胚胎发育异常，如染色体异常、胎儿发育迟缓等，可能导致孕酮偏低。(2)此时，可能还会伴有其他症状，如阴道流血、腹痛等。
4.其他因素：(1)在怀孕初期，女性如果存在胰岛素抵抗、高泌乳素血症等，也可能影响孕酮的代谢，导致孕酮偏低。(2)此外，环境因素、精神因素等也可能对孕酮水平产生一定影响。
需要注意的是，孕酮偏低可能会增加流产的风险。因此，一旦发现孕酮偏低，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。治疗方法包括补充孕激素、卧床休息、调整生活方式等。同时，孕妇应定期复查，密切关注胎儿的发育情况。如果孕酮水平持续偏低，或出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医，以便采取相应的措施。