孕初期孕酮低的原因主要有以下几点：
1.黄体功能不全：(1)怀孕后，黄体分泌孕酮不足，导致孕酮水平下降。(2)黄体过早衰退，使孕酮分泌减少。
2.肾上腺、甲状腺功能失调：(1)肾上腺、甲状腺功能严重失调，会影响卵巢功能，导致孕酮分泌不足。(2)这两个腺体的功能异常，也可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，进而影响孕酮的分泌。
3.胚胎发育异常：(1)孕卵本身发育异常，可能导致孕酮分泌不足。(2)在胚胎发育过程中，若受到某些因素的影响，如染色体异常，也可能导致黄体功能不全，孕酮水平降低。
4.孕妇自身因素：(1)孕妇患有糖尿病、高血压等疾病，可能影响黄体功能，导致孕酮水平下降。(2)孕妇营养不良、压力过大、情绪波动等，也可能影响孕酮的分泌。
5.其他因素：(1)环境中的某些化学物质，如铅、镉等，可能影响孕酮的分泌。(2)吸烟、饮酒等不良习惯，也可能对孕酮水平产生不利影响。
治疗孕初期孕酮低的方法主要有以下几种：
1.一般治疗：注意休息，加强营养，避免劳累和剧烈运动。
2.药物治疗：在医生的指导下，使用黄体酮类药物补充孕酮。
3.定期复查：治疗过程中，需要定期复查孕酮和B超，了解胚胎发育情况。
需要注意的是，孕酮水平低可能会增加流产的风险，因此一旦发现孕酮低，应及时就医，在医生的指导下进行治疗和处理。同时，在孕期应保持良好的生活习惯，合理饮食，适当运动，保持心情愉悦，有助于维持孕酮水平的稳定。