月经后3天同房怀孕的原因主要是女性的排卵时间可能会提前或延后。
女性的排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右。但由于个体差异，有些女性的排卵时间可能会提前或延后，尤其是在月经周期不规律的情况下。因此，即使在月经后3天，女性仍然有可能排卵并受孕。
此外，精子在女性体内可以存活3-5天，因此在排卵前的几天内同房，也有可能导致怀孕。
如果您不希望怀孕，建议在同房时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。同时，也可以通过计算安全期、监测基础体温等方法来辅助避孕，但这些方法并不能完全保证避孕成功，仍存在一定的失败率。
如果您已经怀孕，并且不打算要这个孩子，建议及时就医，进行B超检查，确定孕囊的位置和大小，然后选择合适的终止妊娠的方法，如药流或人流。
总之，为了避免不必要的怀孕和生殖健康问题，建议女性朋友们了解自己的生理周期，掌握正确的避孕方法，并注意保护自己的生殖健康。