眼睫毛根部长了一个小水泡，可能是以下原因引起：
1.麦粒肿：麦粒肿是睫毛毛囊附近的皮脂腺或睑板腺的急性化脓性炎症。表现为眼皮局部红肿、疼痛，有时在睫毛根部会出现一个小水泡。早期可以通过热敷、局部使用抗生素眼膏来治疗。如果脓肿形成，需要切开排脓。
2.睑缘炎：睑缘炎是睑缘的慢性炎症，可能与细菌感染、过敏、维生素缺乏等有关。表现为睑缘充血、红肿，睫毛根部可见小脓疱。治疗需要根据病因进行，如去除病因、使用抗生素眼膏、补充维生素等。
3.其他原因：如疱疹病毒感染、蚊虫叮咬、外伤等也可能导致眼睫毛根部长小水泡。
如果小水泡没有明显的不适，可以先观察一段时间，注意眼部卫生，避免揉眼。如果水泡逐渐增大、疼痛加重或伴有其他症状，如眼睛红肿、分泌物增多等，应及时就医。医生会根据具体情况进行诊断，并给予相应的治疗。
需要注意的是，不要自行挤压或挑破小水泡，以免引起感染扩散。同时，如果有糖尿病等基础疾病，应积极控制血糖，以预防感染的发生。