加味逍遥丸和丹栀逍遥丸的主要区别在于药物成分和功效的侧重点。
加味逍遥丸是在逍遥丸方剂中加入牡丹皮和栀子两味中药。因此，加味逍遥丸除具有逍遥丸的舒肝清热、健脾养血的作用外，还具有清肝热、活血、通经的功效，常用于治疗肝郁血虚、肝脾不和、两胁胀痛、头晕目眩、倦怠食少、月经不调、脐腹胀痛等症。
丹栀逍遥丸是在逍遥丸方剂中增加了牡丹皮和栀子两味中药。因此，丹栀逍遥丸除具有逍遥丸的舒肝解郁、清热调经的作用外，还具有清肝泻火、解郁止痛的功效，常用于治疗肝郁化火、胸胁胀痛、烦闷急躁、颊赤口干、食欲不振或有潮热、以及妇女月经先期、经行不畅、乳房与少腹胀痛等症。