怀孕两个月时出现褐色分泌物可能是以下原因导致的：
1.先兆流产：在妊娠早期，胚胎着床不稳定，过度劳累、性生活、剧烈运动、孕酮水平低等因素可能导致先兆流产，出现阴道少量出血，血液在阴道内停留时间较长时会呈现褐色。
2.宫颈息肉：怀孕期间，孕妇体内激素水平变化可能导致宫颈息肉生长，息肉质地脆弱，触碰后容易引起出血，表现为褐色分泌物。
3.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，以输卵管妊娠最常见。异位妊娠时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起阴道出血，颜色可为褐色。
4.葡萄胎：葡萄胎是一种良性妊娠滋养细胞疾病，由于滋养细胞增生，间质水肿，形成大小不一的水泡，水泡间借蒂相连成串，形如葡萄，也称水泡状胎块。葡萄胎可导致子宫迅速增大，血供不足，容易发生退行性变，引起出血，表现为褐色分泌物。
5.其他：胎盘前置、胎盘早剥、阴道炎、宫颈炎等也可能导致怀孕期间出现褐色分泌物。
需要注意的是，褐色分泌物可能是一些严重问题的信号，也可能是正常的孕期变化，但无论如何，都应该引起重视。建议及时就医，进行B超、孕酮、人绒毛膜促性腺激素（hCG）等检查，以明确原因，并采取相应的措施。
如果确诊为先兆流产，医生可能会建议采取以下措施：
1.卧床休息：减少活动，避免劳累和剧烈运动。
2.补充孕酮：如果孕酮水平低，可能需要补充孕激素，以维持妊娠。
3.定期复查：按照医生的建议定期进行B超检查，监测胚胎的发育情况。
4.注意观察：注意观察阴道出血量和腹痛情况，如果出血量增多、腹痛加剧，应及时就医。
如果是宫颈息肉引起的褐色分泌物，通常需要在医生的指导下进行息肉摘除术。如果是异位妊娠、葡萄胎等情况，可能需要进行手术治疗或其他相应的处理。
在孕期，保持良好的生活习惯和心态也非常重要。注意休息，避免过度劳累和紧张焦虑；保持外阴清洁，避免感染；合理饮食，保证营养均衡；按照医生的建议进行产前检查，及时发现和处理问题。如果出现褐色分泌物或其他异常情况，应及时就医，以便保障孕妇和胎儿的健康。