月经第三天不建议同房，可能会带来以下影响：
1.细菌感染：月经期间，女性子宫内膜脱落，宫腔内有新鲜的创面，且宫颈口处于扩张状态，此时同房，男性生殖器可能会把细菌带入阴道，经血是细菌等微生物的良好培养基，细菌极易滋生，沿子宫内膜内许多微小伤口和破裂的小血管扩散，感染子宫内膜，甚至可累及输卵管和盆腔器官，从而给女方带来不必要的麻烦。
2.子宫内膜异位症：经期同房，由于性冲动时子宫收缩，还可能将子宫内膜碎片挤入盆腔，引起子宫内膜异位症，导致不孕症的发生。
3.免疫性不孕：经期同房，可刺激机体产生抗精子抗体，从而导致免疫性不孕。
4.其他：还可能引起经期延长、经量增多等月经不调的情况。
因此，为了女性的身体健康，建议在月经干净2-3天后再进行同房。如果月经期间已经有了性生活，但没有不适症状，也不必过于担心，以后注意即可。但如果出现了腹痛、发热、阴道分泌物异常等不适，应及时就医，明确是否存在感染，并进行相应的治疗。