南瓜子是一种常见的食材，也是一种传统的中药材，具有多种功效与作用。
南瓜子富含锌，对预防和改善男子前列腺疾症具有很好的药用功效。研究发现“前列腺”病变主要是由于前列腺内含锌量减少之故。经常吃南瓜子，就可以预防和改善前列腺症。
南瓜子中含有大量磷质，如果人们常吃南瓜子，吸收其磷质，就可防止矿物质在人的尿道系统凝结，使之随尿排出体外，达到预防肾结石的目的，还可促进已有结石的排出。
南瓜子含有丰富的泛酸，这种物质可以缓解静止性心绞痛，并有降压的作用。
现代医学研究表明，炒熟后的南瓜子仁还是一种很好的驱虫药，且没有毒性和任何副作用，适宜老人、儿童绦虫病和腹痛胀满等症，对蛲虫病、绦虫病、钩虫病等患者均有明显的效果。
南瓜子不要生食，生食不但口味不好，而且食用后的保健作用不大。已经氧化腐败的南瓜子不要食用，食后容易引起恶心、呕吐、腹痛。胃热病人宜少食，否则会感到脘腹胀闷。