月经后的第三天进行性行为，怀孕的可能性较小，但不能完全排除怀孕的可能。以下是一些可能的情况：
1.安全期：一般来说，月经周期规律的女性，排卵日通常在下次月经来潮前14天左右，排卵日及其前5天和后4天加在一起称为排卵期。除了排卵期和月经期，其他时间被称为安全期。月经后的第三天可能处于安全期，但安全期并非绝对安全，因为女性的排卵时间可能会受到情绪、环境等因素的影响而发生变化。
2.受精与着床：如果在性行为中男方的精子进入女方体内，并与女方的卵子结合形成受精卵，受精卵需要在子宫内着床才能成功怀孕。这个过程受到多种因素的调节，包括卵子和精子的质量、输卵管的通畅性等。即使在安全期，这些因素也可能导致怀孕的发生。
3.个体差异：每个女性的月经周期和排卵情况都有所不同，有些人的排卵时间可能会提前或推迟。此外，一些妇科疾病、药物或其他因素也可能影响排卵和受孕的机会。
如果您担心怀孕，可以考虑以下措施：
1.紧急避孕药：在性行为后的72小时内，可以考虑服用紧急避孕药来减少怀孕的风险。紧急避孕药是一种高效的孕激素，通过抑制排卵或改变子宫内膜环境来达到避孕的目的。但紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，且可能会引起一些副作用，如恶心、呕吐、月经失调等。
2.验孕：在性行为后的适当时间，可以使用验孕棒或早孕试纸进行验孕。然而，验孕的准确性可能受到时间和方法的限制，最好在预计月经来潮日期后一周左右进行检测，或者咨询医生进行更准确的检查。
3.咨询医生：如果您对怀孕的风险非常担忧，或者有其他健康问题，建议咨询医生或妇科专家。他们可以根据您的具体情况提供更个性化的建议和指导。
需要注意的是，避孕是性行为中非常重要的一环，除了安全期和紧急避孕药，还有其他可靠的避孕方法，如避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。选择适合自己的避孕方法并正确使用，可以有效降低怀孕的风险。此外，如果您有任何关于性健康或生殖健康的问题，及时咨询专业医生是明智的选择。