月经推迟三天且肚子隐隐作痛，可能是以下原因导致的。
1.怀孕：在怀孕早期，受精卵着床时可能会引起小腹隐痛，同时伴有月经推迟。
2.月经失调：生活不规律、压力过大、情绪波动等因素可能导致月经失调，引起月经推迟和腹痛。
3.妇科疾病：如盆腔炎、子宫内膜异位症等，也可能导致月经推迟和腹痛。
4.其他因素：如药物副作用、体重变化、环境改变等，也可能影响月经周期和引起腹部不适。
如果月经推迟超过七天，或腹痛持续不缓解，或伴有其他症状，如恶心、呕吐、阴道出血等，应及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。