月经推迟三天肚子隐隐作痛，可能由多种原因引起。首先，怀孕是常见原因之一，女性可以通过早早孕试纸检测，一般在月经推迟一周左右检测较准确，若怀孕早期着床可能会有轻微腹痛。
一、怀孕相关情况
正常妊娠早期： 受精卵着床时部分女性会有轻微下腹隐痛，同时伴有月经推迟，这是正常的生理现象，一般疼痛较轻微，不伴有阴道大量出血等异常情况。异位妊娠： 如果是异位妊娠，也会出现月经推迟，然后有肚子隐隐作痛的情况，而且随着胚胎的发育，可能会出现一侧下腹部撕裂样疼痛等严重情况，需要及时就医通过超声等检查来明确。
二、月经即将来潮的表现
激素变化影响： 在月经即将来潮前，体内激素水平会发生变化，有些女性会出现下腹隐隐作痛的感觉，同时月经推迟3天属于比较常见的情况，一般这种疼痛程度较轻，随着月经的来潮会逐渐缓解。盆腔充血因素： 月经前盆腔处于充血状态，也可能导致肚子隐隐作痛，通常月经来潮后盆腔充血缓解，疼痛也会减轻。
三、妇科疾病因素
盆腔炎： 患有盆腔炎的女性可能会出现月经推迟，同时伴有下腹部隐痛，疼痛可能为持续性，在劳累、性交后会加重，还可能伴有阴道分泌物增多等症状。子宫内膜异位症： 子宫内膜异位症患者也会有月经推迟情况，肚子隐隐作痛，疼痛多位于下腹部、腰骶部等，且会随月经周期加重。