跑步时右边肚子疼，可能是以下原因引起：
1.内脏器官扭转：跑步时，内脏器官会受到震动和牵扯，如果内脏器官本身存在扭转、打结等问题，就可能导致肚子疼。
2.肠道问题：肠道炎症、肠痉挛、肠梗阻等肠道问题也可能导致肚子疼。
3.腹肌劳损：跑步时，腹部肌肉需要不断收缩和放松，如果腹肌过度疲劳或劳损，就可能导致肚子疼。
4.其他原因：跑步时呼吸不当、运动前饮食不当、缺乏热身等也可能导致肚子疼。
针对不同原因引起的肚子疼，治疗方法也不同。如果是内脏器官扭转等严重问题，需要及时就医治疗；如果是肠道问题，可以通过调整饮食、药物治疗等方法缓解；如果是腹肌劳损，可以通过休息、按摩、热敷等方法缓解。
总之，如果跑步时出现右边肚子疼的情况，需要及时停止运动，休息观察。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如呕吐、发热等，应及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。