阴茎时不时隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.尿道炎：尿道发生炎症时，阴茎可能会疼痛。尿道炎通常由细菌感染引起，也可能与其他健康问题有关。
2.前列腺炎：前列腺是男性生殖系统的一部分，如果前列腺发生炎症，可能会导致阴茎疼痛。前列腺炎还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
3.阴茎损伤：阴茎受到直接的损伤，如挫伤、割伤、咬伤等，可能会引起疼痛。此外，过度自慰或性生活过于激烈也可能导致阴茎损伤。
4.阴茎硬结症：这是一种在阴茎海绵体中形成硬结的疾病，可能导致阴茎弯曲和疼痛。阴茎硬结症的原因尚不清楚，但可能与遗传、损伤或自身免疫性疾病有关。
5.性传播感染：某些性传播感染，如淋病、梅毒、生殖器疱疹等，可能会引起阴茎疼痛。这些感染通常还伴有其他症状，如尿频、尿急、分泌物异常等。
6.其他原因：阴茎疼痛还可能与精索静脉曲张、包茎、附睾炎、阴茎癌等疾病有关。
需要注意的是，阴茎疼痛可能是严重疾病的症状之一，因此如果出现这种情况，应及时就医。医生会进行详细的身体检查和必要的实验室检查，以确定疼痛的原因，并制定相应的治疗方案。
对于特殊人群，如儿童、老年人、糖尿病患者、免疫功能低下者等，阴茎疼痛可能需要特别关注。这些人群更容易患上泌尿系统感染或其他潜在的健康问题，因此应及时就医并接受适当的治疗。
此外，保持良好的个人卫生习惯，如勤洗阴茎、避免过度自慰和性生活过于激烈等，有助于预防阴茎疼痛的发生。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，应立即就医。