引起眨眼眼睛疼的原因有很多，需要先明确病因，再进行针对性治疗，以下是一些可能的原因和治疗方法。
1.感染：如果眼睛发红、流泪、分泌物增多，可能是感染引起的，如结膜炎、角膜炎等。可以使用抗生素眼药水或眼膏治疗，如左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼膏等。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼，勤洗手。
2.干眼症：长时间使用电脑、手机等电子设备，或长期佩戴隐形眼镜，可能导致眼睛干涩、疼痛。可以使用人工泪液滴眼，如玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等。同时，要注意眼睛的休息，避免长时间用眼，定期更换隐形眼镜。
3.视疲劳：长时间阅读、写作、看电视等，可能导致眼睛疲劳、疼痛。可以通过休息、远眺、按摩等方式缓解。同时，要注意保持正确的用眼姿势，避免在昏暗的光线下用眼。
4.青光眼：眼压升高可能导致眼睛疼痛、头痛、恶心等症状。需要及时就医，进行眼压测量和视野检查。如果确诊为青光眼，需要使用降眼压药物或手术治疗。
5.其他：眼睛外伤、虹膜炎、白内障等也可能导致眨眼眼睛疼。需要及时就医，进行详细的眼部检查，明确病因后进行治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，以免延误病情。同时，对于孕妇、儿童、老年人等特殊人群，应在医生的指导下使用药物。