卵巢巧克力囊肿的治疗方法主要包括以下几种：
1.药物治疗：
口服避孕药：通过抑制排卵、减少月经量，缓解痛经等症状。
孕激素：可使异位的子宫内膜萎缩，缓解病情。
GnRH激动剂：可抑制卵巢功能，导致闭经，使异位的子宫内膜逐渐萎缩。
2.手术治疗：
保守性手术：保留卵巢功能，只切除囊肿，适用于年轻、有生育要求的患者。
半根治性手术：切除子宫及双侧附件，适用于年龄较大、无生育要求的患者。
根治性手术：切除全子宫及双侧附件，适用于病情严重、恶变倾向或保守治疗无效的患者。
3.介入治疗：
超声引导下囊肿穿刺抽液并注入硬化剂：可破坏囊肿壁，减少囊肿复发的机会。
腹腔镜手术：通过腹腔镜下囊肿剔除、电凝等操作，达到治疗目的。
需要注意的是，治疗方法的选择应根据患者的年龄、症状、生育要求、囊肿大小等因素综合考虑。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗方案，并定期进行复查，以评估治疗效果。同时，患者还应注意生活方式的调整，保持良好的心态，有助于病情的恢复。