肛门长了个小肉球并伴有疼痛，可能是痔疮、肛裂、肛周脓肿等疾病引起，消除方法需要根据具体病因来选择，以下是一些常见的治疗方法：
1.调整饮食：多吃蔬菜、水果等富含膳食纤维的食物，避免辛辣、油腻食物，保持大便通畅，防止便秘加重病情。
2.温水坐浴：每天用温水坐浴15-20分钟，缓解肛门疼痛，促进局部血液循环。
3.局部外用药物：在医生的指导下使用痔疮膏、痔疮栓等药物，减轻肛门疼痛和肿胀。
4.口服药物：如果疼痛严重，可以口服止痛药缓解症状。同时，还可以使用一些具有清热、消肿、止痛作用的中药口服。
5.手术治疗：如果上述方法治疗效果不佳，或者病情较为严重，可能需要手术治疗。手术方式包括痔切除术、肛裂切除术、肛周脓肿切开引流术等。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方法需要根据患者的具体情况来选择。如果肛门长了小肉球并伴有疼痛，建议及时就医，明确诊断，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持肛门清洁卫生，避免久坐、久站，养成良好的排便习惯。