HPV39阳性时是否可以同房，需要根据具体情况来判断。一般来说，不建议在HPV39阳性时同房，以下是原因：
1.HPV感染具有传染性，主要通过性接触传播。HPV39阳性表示存在HPV39型病毒感染，此时同房可能会将病毒传染给性伴侣。
2.HPV感染后，宫颈可能会出现病变。在病变没有恢复之前同房，可能会加重病情，影响治疗效果。
3.即使HPV感染没有引起宫颈病变，同房时也可能会导致宫颈损伤，使病毒更容易入侵，增加HPV持续感染和病变的风险。
但是，如果经过医生评估，HPV39阳性且宫颈没有病变，或者病变已经治疗好，那么可以在医生的指导下同房。在同房时，需要注意以下几点：
1.使用安全套可以减少HPV的传播，但不能完全避免。
2.定期进行宫颈癌筛查，以及时发现和处理HPV感染和宫颈病变。
3.保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、戒烟限酒等，有助于提高免疫力，促进HPV感染的清除。
需要注意的是，HPV感染是一种常见的疾病，但大多数HPV感染会在1-2年内自然清除。如果持续感染HPV，尤其是高危型HPV，可能会增加宫颈癌的发生风险。因此，对于HPV感染，需要引起重视，但也不必过于恐慌。如果对HPV感染或同房问题有疑问，建议咨询医生，以便获得更专业的建议和指导。