HPV39阳性是否可以同房，取决于具体情况。
一般来说，如果HPV39阳性没有引起任何症状，且医生认为不需要治疗，那么可以同房，但需要使用安全套，以避免交叉感染。如果HPV39阳性引起了疣体或其他病变，或者医生认为需要治疗，那么在治疗期间应避免同房，以免影响治疗效果或加重病情。
需要注意的是，HPV感染是一种常见的性传播疾病，不仅会引起尖锐湿疣等性病，还会导致宫颈癌等恶性肿瘤。因此，如果发现HPV39阳性，应及时就医，接受正规的治疗，并注意个人卫生和防护，避免传染给他人。同时，应定期进行宫颈癌筛查，以早期发现和治疗宫颈癌前病变。