肛瘘通常必须手术治疗，药物治疗一般只能暂时缓解症状，无法彻底治愈。比如大部分肛瘘患者通过手术能获得较好的治疗效果，单纯靠药物很难让肛瘘自愈。
手术治疗的必要性
肛瘘形成机制：肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤间形成的异常通道，由内口、瘘管、外口组成，一般无法自行愈合，药物治疗很难打通这个异常通道，所以大多需要手术。避免病情加重：肛瘘若不及时手术，可能会反复发作，炎症反复刺激还可能导致瘘管增多、复杂程度增加，增加治疗难度和痛苦。
哪些情况建议手术
单纯性肛瘘： 对于低位单纯性肛瘘，手术相对简单，通过切除瘘管等操作往往能有效治愈，一般术后恢复较好，住院时间可能在1周左右。复杂性肛瘘： 复杂性肛瘘虽然手术难度大一些，但也需要通过手术来清除病变组织，重建正常的肛门结构，否则病情会持续恶化，影响生活质量。
手术方式选择
瘘管切开术： 适用于低位肛瘘，将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。术后要注意保持肛门清洁，每天可坐浴1 - 2次，促进伤口恢复。挂线疗法： 多用于高位肛瘘，利用橡皮筋的机械压迫作用，缓慢切开瘘管，这种方法对括约肌损伤较小，术后疼痛相对较轻，但需要定期紧线。