瞳孔颜色不一样的原因有以下几点：
1.虹膜异色症：这是一种先天性疾病，患者的两只眼睛会呈现出不同的颜色。这种情况通常是由于虹膜色素分布不均匀或缺乏某些色素导致的。虹膜异色症可能是家族遗传的，也可能是由于基因突变引起的。
2.眼部疾病：某些眼部疾病也可能导致瞳孔颜色不一样。例如，角膜炎、虹膜炎、青光眼等疾病可能会影响虹膜的颜色和结构。
3.药物副作用：某些药物可能会导致瞳孔颜色改变。例如，长期使用某些抗生素、抗抑郁药等药物可能会引起虹膜色素沉着或褪色。
4.外伤：眼部外伤或手术可能会导致虹膜损伤或改变，从而影响瞳孔的颜色。
5.年龄因素：随着年龄的增长，虹膜的色素会逐渐减少，导致瞳孔颜色变浅。
6.其他因素：某些情况下，瞳孔颜色的改变可能是暂时的，例如在强光下，瞳孔会缩小，颜色看起来会更浅。
需要注意的是，如果瞳孔颜色的改变是突然发生的，或者伴有其他症状，如视力下降、眼睛疼痛、头痛等，应及时就医进行检查，以确定原因并采取相应的治疗措施。